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  把超算的强壮功能转化成处理生命科学重大问题的实践才能，国家超级核算无锡中心获得新打破。日前，中心传来喜讯，科研团队成功构建新一代功能可移植虚拟挑选结构，可完结每日1.9万亿次蛋白质与配体分子对接的理论核算速度。若以银河系中约4000亿颗恒星为参照，该结构单日完结的挑选量，相当于5个银河系的恒星总量，挨近整个人类蛋白质组的规划。

  在现代药物研制中，前期发现阶段常被描述为“难如登天”；虚拟挑选技能则像一套“智能导航”，协助科研人员在化合物的海洋中快速锁定目标。“咱们根据物理化学原理，在核算机上对化合物数据库中的分子进行预挑选，识别出最大有可能与靶点结合的小分子，再做进一步生物学试验验证。”国家超算无锡中心高功能研制中心生命材料部副部长、新药发现渠道负责人沈成介绍。

  但是，一次虚拟挑选往往需调用大规划高功能核算集群接连运行数周，本钱预算高达数千万元，让绝大多数研制组织望而生畏。为此，北京生命科学研究所/清华大学生物医学穿插研究院黄牛课题组联合山东大学、清华大学、国家超算无锡中心组成跨学科团队，安身“威风”系列超级核算机，环绕底层硬件架构展开深度软件优化，研制高效虚拟挑选软件。团队于2022年发布的首个版别每日可完结700亿配体挑选，功能已达世界领先水平。

  “新的结构能够更好地使用新一代威风超算的算力，挑选速度又提升了一个数量级。”沈成和记者说，团队在“威风”超算上继续优化算法，推出了全面晋级的SWDOCKP^2结构，现在可一起对接8个蛋白质靶标结构，到达每日1.9万亿次的理论挑选速度。

  据悉，以SWDOCKP^2为中心的药物发现核算渠道已开始面向国内外科研组织及医药企业敞开试用，在多类创始新药研制项目中获得发展。北生所已有多个新药靶点凭借该渠道获得概念性验证和先导化合物的发现，中国科学院天津工业生物技能研究所正根据该渠道规划新式小分子抑制剂，上海科技大学相关团队在嗅觉受体配体发现方面获得活跃发展，北京、上海、姑苏等地的多家新药研制企业也凭借渠道挑选出一批小分子预兆化合物，为后续新药研制奠定根底。

  以超算之力破局新药研制难题，该核算渠道不只打破了长期以来的算力资源与技能壁垒，更将大幅度缩短候选药物的前期发现周期，下降研制危险及本钱。未来，渠道将会聚全世界立异力气，加快潜在医治靶点的发掘与先导化合物的挑选，助力霸占各类疑问疾病，推进全世界立异药物研制进入高效、普惠的新阶段。